应该说，自我国改革开放以来，工商行政管理部门在深圳公司的登记管理工作中做了很多工作。它为促进我国的改革开放，建立和逐步完善市场经济体制做出了贡献。市场交易的秩序和安全性做出了有益的贡献。但是，如果从理论和实践的角度进行检验，我国目前的深圳公司注册管理制度确实存在很多问题。最突出的问题是行政管理能力强，而深圳公司注册的公共服务能力弱。具体体现在：首先，按照行政区划，深圳市公司登记机关和典型的行政机关工商行政管理机关完全重叠。根据《深圳公司注册管理规定》第4条：“工商行政管理部门是深圳公司注册机构。下级深圳公司注册机构在上级领导下进行公开注册，一级深圳市代理公司登记机关。在实践中，每个工商行政管理部门分为企业登记局，企业登记局，卫生署和公司其他职能部门。这样客观地形成了以下情况：首先，深圳公司登记机关被埋在各级工商局中，失去了对外独立性。第二，深圳市公司登记机关必须接受纵向和横向双重领导和管理。深圳代理注册公司代理机构是工商行政管理总局下设的职能部门，必须完全由工商行政管理总局控制；第三，公司注册代理机构的性质和职能被工商行政管理部门的性质和职能完全稀释和吸收。这是因为工商行政管理机关主要行使工商行政管理权力，而深圳市公司登记机关只是内部职能部门。深圳公司登记机关的工商行政管理机构在形式上和内容上完全重叠，不能突显深圳公司登记的公共服务，而只能体现其强烈的政治管理色彩，即行政性。其次，在深圳公司登记授权制度中，包括国家工商行政管理总局在内的深圳公司的登记事务，也根据公司创始人的身份自上而下专门负责登记事务。这不仅符合确定注册管辖权为标准的国际原则，而且人为地造成了注册管辖权与注册查询之间的混淆，给实践带来了不便。第三;有很多事实，在我国深圳公司注册的实践中，由于深圳公司注册机构成立的现状，普遍存在着强调管理，忽视服务的现象。在我国，深圳公司注册通常被理解为政府管理的经济体。这是重要的行政部分。因此，注册不仅是建立公司帐户，更重要的是，注册是对公司业务活动的监督和管理，我们称之为注册和管理。 “受此影响，该国现行有关深圳公司注册的单独立法被直接称为“深圳公司注册和管理条例”，而不是“深圳公司注册条例”。