“干货”中常见实验大鼠/小鼠的命名原则
名字是个人的同义词。我们通常通过名字来识别和记录一个人或个人。“名字”这个词已经用了很长时间。在孙子的房间里,“卫之名,左右之名,观众之名,门之名,家之名,今必知之名”中已经提到了“名”字。
而且我们的老鼠不是“无名氏”!早在大鼠和老鼠出生之前,它们就已经被命名了!当然,大鼠和老鼠的重名率非常高,但这并不是因为我们懒惰,而是因为它们长得太像了!!!
Jackson是鼠标模型的金标准,他们的鼠标命名原则被业界广泛认可。为了让大家更清楚地了解大鼠小白鼠是如何被“贴上标签”的,我们来介绍一下杰克逊的命名方法。
Jackson实验室小鼠命名金标准
同源交配
C57BL/6J=B6
129S1/SVIMJ=129S
杂交系
B6129SF1/J
亲子实验室的缩写
自发或诱导突变体
鼠标背景
突变基因
突变等位基因
实验室简称
敲除敲倒
鼠标背景
混合背景标记
捐助者背景
突变基因
定向突变
等位基因
基因编辑实验室编码
实验室简称
转基因小鼠
鼠标背景
同源系标记
捐助者背景
转基因缩写
启动子
基因名称
实验室指定序列号
实验室规程
实验室简称
相信通过以上的介绍,大家一定对老鼠的命名有所了解。
作为一家基因生物技术公司,百奥赛图依托CRISPR技术构建小鼠模型,是多家科研院所和公司的合作单位。和千斤顶
对CRISPR编辑技术来说,《实验鼠》的命名方法有些冗杂和不清晰。
为了让客户能够快速选择合适的型号鼠标,百奥赛图结合鼠标命名准则和公司产品鼠标,编辑了一套公司专属命名模式。下面给大家介绍一下:
一、命名原则
规范命名:参照国际通用和Jackson实验室命名标准,要求基因名称书写准确、标准、规范。
常规命名:易于使用,表达精炼美观,要求符合大多数人的使用习惯。
包含信息:动物名称、基因名称、基因组编辑、实验室(公司)简称等。
二、命名构图
1
(以B-hPD-1小鼠为例)
鼠标背景
基因名称缩写(必须是NCBI基因的官方名称)
目标射击策略记录(目标突变1/2/3…)
靶向策略标记(以H+人类基因名称人源化)
公司简称(实验室简称)
!!!一定要记录实验室或公司的缩写,因为大鼠自身的基因和表型受到环境的影响。
2
(以B-hPD-1小鼠为例)--通用命名
B-HPD-1小鼠
公司简称(必需标记)
人化标记(非人化可忽略)
基因缩写
物种类别
桌子。其他拍摄策略命名
3
(以B-hPD-1小鼠为例)-其他原理
如果该基因在NCBI上除官方名称外还有通用名称,则可以在该基因的常规名称后用括号标注:如果PD-L1基因的官方名称为CD274,通用名称为PD-L1,则该基因的人源化小鼠的常规名称均称为B-hCD274(PD-L1)小鼠,也可以是
是B-hPD-L1小鼠。
小鼠基因的书写方式与人类基因不同:人类基因全部用大写字母表示,而小鼠基因开头大写,其余都是小写,如PD-1为人类基因,Pd1为小鼠基因。
你理解了吗?如果您有任何问题,请随时打电话咨询。也希望大家能找到自己喜欢的老鼠!
封面图片在图片网络
美国生物细胞原
百奥赛图基因生物科技有限公司上海办事处
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