地铁是日本日常生活中重要的城市轨道交通。日本第一条地铁线路是东京地铁（现东京地铁银座线），开通于1927年。它是亚洲第一个拥有地铁的国家。目前，有9个城市拥有地铁系统。
        一、东京地铁
        东京是亚洲第一个拥有地铁线路的城市，最早运营的线路银座线无浅草段于1927年12月通车。目前共有13条线路（东京地铁9条线路、都营地铁4条线路）、285座车站（东京地铁179条线路、都营地铁106条线路，其中多条线路共用的车站重复计算）。线路全长公里（东京地铁全长公里，都营地铁全长109公里；不含直达区间）。2018年，两社日均客运量合计1040万人次。是美国最繁忙的纽约地铁（2018年日均客流量1万人次）的两倍多。
        东京的地下铁路线大部分位于东京首都圈，但其中10条与JR线等私人铁路线直接运行，使得整体服务范围延伸至整个首都圈，以东京都为中心覆盖神奈川县、埼玉县、千叶县和茨城县。东京的每一条地下铁路线都与环形运行的山手铁路上的车站相交，包括JR、私人铁路和地下铁路线汇聚的几个大型换乘站（如池袋站、新宿站和涩谷站），增加了换乘选择。但有时换乘需要稍长一点的步行距离，有的站点复杂得像迷宫。值得一提的是，东京地铁的英文名是Tokyo Metrone，Toei地铁是Dukiao Metrone，由上述两者组成的东京地铁系统的英文名是Tokyo Subywood，读者需要加以区分。
        二、大阪地铁（大阪高速电动轨道）
        大阪地下铁道线路全长公里（不含AGT规范线路和直达运营线路），日均运量近292万人次（2017年统计），为一天
        本市最繁忙的地铁系统之一。
        三、名古屋城市地铁
        名古屋市办地铁于1957年11月15日通车（今东山线：名古屋-荣健段），是一条已有60多年历史的交通系统。在名古屋修建地铁的计划于1936年提出，这一年该市人口突破100万；按照规划，将分两期建设7条线路，总长52公里。1954年8月，名古屋至荣定（今荣湛）段开工建设。1957年11月15日，名古屋至荣定段通车。
        四、札幌市地铁
        札幌市地铁由日本札幌市交通局运营。目前有南北线、东西线、东风线三条运营线路。除汉道区、青田区外，其他各区均已通过，均采用胶轮轨道系统。
        V.横滨市办地铁和香港未来线
        1.横滨市办地铁是由日本横滨市交通局运营的地铁。在横滨市的相关规定中，正式命名为横滨高速铁路系统，共有2条路线，全长公里，40个车站。服务范围覆盖横滨市18个行政区中的11个，隔壁藤泽市也有一个车站（香南车站）。
        2.香港未来线是位于日本神奈川县横滨市的一条铁路线，隶属于横滨高速铁路，起点位于市西区的横滨站，终点位于市中区的原町中华街站。它在《城市规划法》中作为城市高速铁路的名称是“横滨国际港口基本建设计划城市高速铁路4号港未来21线”。《铁路概览》所载路线名为“香港未来二十一号线”，但乘客资料中并无使用。线路图和站号所用的路线颜色为蓝色，路线标记为MM。
        VI.神户市地铁
        神户市营地铁是日本兵库县神户市的地铁，由神户市交通局运营。神户地铁虽然名义上有5条线路，但西神延长线、西神线、山手线与“西神山手线”统一运行，北神线也与这条线路直接相连，所以实际上与海岸线一起
        只有两条路线；如果将北神线单独计算，则有三条路线。有路线途经神户市西区、须磨区、永田区、兵谷区、中区、北区等6个区。北深线原由阪急电铁旗下的北深吉星电铁运营。2020年6月1日起，正式将资产出售给神户交通局，成为神户市办地铁的路线。
        七、日本北普铁（东京/千叶）
        北普铁路有一公里的路线，其中一部分由千叶新城铁路拥有。在这一段，是第二个铁路企业，2010年7月17日延长到成田机场。北公交是由北普铁运营的铁路线，连接东京都葛石区的京城高砂站和千叶县印溪市的音站日本医科大学站。车站编号所用的路线标记为HS。
        八。广岛的新交通
        在技术上，广岛的新交通使用自动引导的捷运系统设计。在日本各地的地铁系统中，只有广岛和北海道札幌地铁使用类似技术。广岛新交通1号线是连接日本广岛县中区本通站至同城安佐南区的广域公园前站，属于广岛高速交通的AGT路线。昵称为阿斯特拉姆线，日语意为“明天”，英语意为“电车”，当地简称阿斯特拉姆。全线位于广岛县广岛市，城北站与白岛站之间的新白岛站于3月14日开通。
        IX.福冈地铁
        福冈地铁是福冈市交通局运营的地铁。共有三条路线，全长公里。福冈地铁的官方名称其实是“福冈高速铁路”，但在给乘客的信息中，中文使用的是“福冈市办地铁”，日语使用的是“福冈市地下铁道”。九州客运铁路的机场线和肥楼线相互直通。福冈地铁的车辆将从西浜站继续驶入肥楼线区间直至原神江站，九州客运铁路的车辆则将驶入机场线直至福冈机场站。目前，Boxaki线和七威线并没有与其他铁路公司直接连接，但
        博崎线在北嘴站与西日本铁路北嘴线相连，目前已讨论是否相互直通，但目前仍无直通计划。
        十、京都城营地铁
        京都市地铁是京都市交通局运营的地铁系统，共有乌丸线和东西线两条线路。东西线除了连接京都市除西京地区以外的10个分行政区外，还在邻近的宇治市设有车站。虽然在运营中被称为“市办地铁”，但在一些与规定或特许权相关的官方文件中，这一系统以京都高速公路命名。
        十一、东冶高铁
        所谓“高速铁路”，并不是指新干线等高速铁路，而是指城市高速铁路。东野高速是连接千叶县船桥市西双桥站和千叶县八千代市东野盛田站的铁路线，由东野高速运营。车站编号所用的线路标记为TR。东野高速公路原名“盛天台线”，是1972年城市交通审议委员会第15号报告中东西线的延伸。该计划的目的是在8000个城市分担北京成本线沿线的客流。
        十二。东京临海高速铁路
        东京临海高铁，简称东林，简称TWR，是东京都品川区和JR东日本共同出资成立的第三部门铁路公司，主要经营临海线。