水利工程监理单位应先向当地工商部门申请营业执照，办完营业执照后，再向当地房屋建设部门申请水利工程监理资格证书。

办理营业执照流程:

1. 准备5-10个公司名称;

2. 确定公司的注册地址、注册资本和经营范围;

3、到工商局进行公司名称核查;

4、带着所有文件、申请材料到工商局申请营业执照;

5、到公安局备案刻点刻公司印章;

6. 办理税务登记，并在银行开立基本账户。

水利工程监理资质所需材料有:

1、《工程监理单位资质申请表》一式三份(通过企业身份验证锁在广西建设网企业资质管理系统进行在线申报，下载并打印;

2. 企业法人营业执照复印件;

3.章程

4. 企业法定代表人身份证、简历、聘任书;

5. 身份证明、个人简历、聘任(就业)证明、毕业证书、相关专业学历证书、职称证书及《中华人民共和国注册监理工程师注册执业证书》复印件，并加盖执业印章;

6. 注册执业人员的身份证和加盖执业印章的注册执业证书;

企业质量管理体系、技术和档案管理体系认证材料;

8. 工程检测、检测设备采购清单(填写申请单)。